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Journée du 12 juin 2019
8h30-9h : Accueil des participants
9h-9h30 : Ouverture du colloque & Etat des lieux de la métabolomique en Région Sud-PACA
9h30-10h15 : Conférence plénière
Pr Alain BOUCHEREAU (Université de Rennes 1, Responsable de la plateforme Corsaire)
Métabolomique fonctionnelle de la sénescence et de la réponse aux stress chez le colza
10h15-10h45 : Pause-café (Session posters / Stands industriels)
Session 1 : Modérateurs : Gérald Culioli & Jean-Charles Martin
10h45-11h05 : Raphaël Lugan (Qualisud, Avignon) « Différentes approches métabolomiques appliquées à la génomique fonctionnelle chez les végétaux »
11h05-11h25 : Bénédicte Heral (ICN, Nice) « Etude métabolomique des interactions chimiques dans le dépérissement de la lavande »
11h25-11h45 : Stéphane Greff (IMBE, Marseille) « Leaf specialized metabolome of Quercus pubescens exposed to amplified drought »
11h45-12h05 : Laëtitia Fougere (ICOA, Orléans) « Analyse ciblée et non-ciblée de variétés de soie de maïs »
12h05-12h15 : Christophe Siroit (Waters) « Bénéfices des solutions en chromatographie et spectrométrie de masse Waters dans les approches de métabolomique ciblées et non ciblées »
12h15-12h25 : Thierry Legoupil (Shimadzu) « Innovations & nouveautés introduites par Shimadzu »
12h25-13h45 : Pause déjeuner (Session posters / Stands industriels)
Session 2 : Modérateurs : Stéphane Greff & Thierry Pourcher
13h45-14h05 : Charlotte Simmler (CENAPT, Chicago, USA) « Apport des analyses métabolomiques par RMN pour déterminer l’authenticité des plantes médicinales »
14h05-14h25 : Doriane Dumont-Bancel (INRA, Avignon) « Caractérisation de la variabilité génétique de la qualité des baies de goji par profilages métaboliques multi-ciblés »
14h25-14h45 : Jocelyn Gal (Centre Antoine Lacassagne, Nice) « Comparaison de 5 méthodes d’apprentissage non supervisées dans le cas de données de grandes dimensions : Application dans le cancer du sein »
14h45-15h05 : Jean-Charles Martin (C2VN, Marseille) « Une approche combinée de lipidomique, d’imagerie MS et d’imagerie TEP-Scan révèle des différences de fonctionnement cérébral chez le raton selon le contenu lipidique de formules infantiles »
15h05-15h20 : David Chardin (Centre Antoine Lacassagne, TIRO, CEA, Nice) « Métabolomique et Imagerie TEP-FDG des cancers du sein »
15h20-15h25 : Benoît Sarazin (Proteomic Solutions) « Technologie BIOCRATES en métabolomique ciblée »
15h25-15h30 : Pascal Tartarin (Thermo Fisher) « L’apport de la GCMS haute résolution Orbitrap à la métabolomique »
15h30-15h55 : Pause-café (Session posters / Stands industriels)
Session 3 : Modérateurs : Raphaël Lugan & Thomas Michel
15h55-16h10 : Imene Bousahba (C2VN, Marseille) « Impact de la matière grasse laitière sur le métabolome de l’Homme et du porc et identification de biomarqueurs de l’athérosclérose »
16h10-16h30 : Aurélie Seassau (INRA, Sophia-Antipolis) « LC‐MS/MS identification and quantification of phytohormones involved in plant defense mechanisms »
16h30-16h50 : Caroline Lecareux (IMBE, Marseille) « Le contenu en composés organiques volatiles varie-t-il en réponse à l’adaptation des espèces au changement de régime de feu ? »
16h50-17h10 : Slimane Chaïb (CRIOBE, Perpignan) « Processus allélopathique et bio-herbicide : étude métabolomique de la diversité micro-algale et caractérisation de substances allélochimiques assistée par les réseaux de similarités »
17h10-17h30 : Benoît Paix & Nathan Carriot (MAPIEM, Toulon) « Couplage de l’analyse du métabolome et du microbiome associés à la surface de l’algue brune Taonia atomaria »
17h30-18h : Bilan de la journée
18h-20h : Cocktail dinatoire & Dégustation de vins rosés (par le Centre de recherche et d’expérimentation sur le vin rosé de Vidauban, Var)
Journée du 13 juin 2019
8h30-9h : Accueil des participants
9h-10h30 : Session 1
- Emilie Stierlin & Thomas Michel (ICN, Nice) « Métabolomique & Méthodes d’extraction en écologie chimique » (45 min)
- Jean-Marie Guigonis (Plateforme Rossi, Nice) « Le couplage LC/MS/MS en métabolomique clinique » (15 min)
- Thierry Legoupil (Shimadzu) «Améliorer la détection et la qualité de vos données avec l’Ultra-Fast QTOF LCMS-9030 » (10 min)
- Olivier Hutinel (Sciex) «The power of SWATH applied to metabolomic» (10 min)
10h30-11h : Pause-café (Session posters / Stands industriels)
11h-12h30 : Session 2
- Thierry Berton (C2VN, Marseille) « Présentation du workflow de retraitement des données pour une étude métabolomique par LC-HRMS » (30 min)
- Christophe Siroit (Waters) « MetaboQuan et LipidQuan – Méthodes clés en main pour l’analyse ciblée des lipides et des métabolites » (10 min)
- Stéphane Greff (IMBE, Marseille) « Traitement métabolomique de données GC-MS avec le script Erah » (30 min)
- Sébastien Folz (Thermo Fisher) « La nouvelle génération de LCMS haute résolution Orbitrap : l’Exploris 480 » (10 min)
12h30-13h45 : Pause déjeuner (Session posters / Stands industriels)
13h45-15h15 : Session 3
- Catherine Tardivel (C2VN, Marseille) « Annotations sous Galaxy (W4M) » (30 min)
- Nathan Carriot (MAPIEM, Toulon) « Initiation à l’annotation via l’approche par réseaux moléculaires (GNPS) » (30 min)
- Benoît Sarazin (Proteomic Solutions) « Analyse de la relation hôte-microbiote intestinal par métabolomique : Développement d’un dosage ciblé normalisé et quantitatif » (10 min)
15h30-17h : Session 4
- Benoît Paix (MAPIEM, Toulon) « Traitement statistique de jeux de données multi-omiques (Mixomics) » (30 min)
- Jean-Charles Martin (C2VN, Marseille) « Fabrication et validation de biomarqueurs multiplexes » (30 min)
- Baninia Habchi (C2VN, Marseille) « PREDRET, un outil en ligne de prédiction des temps de rétention entre différents systèmes chromatographiques » (30 min)
17h : Bilan de la journée & Prospectives